Дейвід Духовни (David Duchovny / Дэвид Духовны) народився 7 серпня 1960 р. у Нью-Йорку. Його батько, Абрам, був публіцистом Американського Єврейського комітету, мати, Маргарет, – вчителем початкової школи. Батьки розлучилися, коли Дейвіду було 11 років. У нього є старший брат Денієл та молодша сестра Лорі. Дейвід ріс тихим і сором’язливим хлопчиком, через що брат часто дражнив його. Сім’я жила в одній кімнаті маленької квартири, яку знімала на Мангеттені. Батьки не знали, чим зайняти увагу сина, а потім знайшли вихід – шотландська бабуся Дейвіда навчила його в’язати, і вони часто сиділи зі спицями і нитками на колінах. Духовни згадує, що він навіть зв’язав тоді для своєї собаки підстилку.
